More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2808 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2808  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.704243  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4256  Ppx/GppA phosphatase  68.15 
 
 
292 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.429083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1432  Ppx/GppA phosphatase  52.4 
 
 
312 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.798676  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4534  Ppx/GppA phosphatase  45.99 
 
 
296 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2076  Ppx/GppA phosphatase  42.51 
 
 
294 aa  252  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1637  Ppx/GppA phosphatase  39.58 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0606324  normal  0.0168226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3684  Ppx/GppA phosphatase  42.01 
 
 
293 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131918  normal  0.207206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11908  putative exopolyphosphatase  42.86 
 
 
278 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0350  Ppx/GppA phosphatase  40.48 
 
 
300 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1739  hypothetical protein  47.97 
 
 
193 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  27.67 
 
 
505 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
303 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 
553 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
511 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  28.2 
 
 
304 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.76 
 
 
507 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  28.67 
 
 
508 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 
519 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 
312 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 
321 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  27.04 
 
 
491 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
502 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
501 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
570 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  25.16 
 
 
544 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  24.58 
 
 
502 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  23.86 
 
 
549 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.32 
 
 
304 aa  92  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  23.68 
 
 
314 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  27.33 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  25.41 
 
 
532 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.08 
 
 
513 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  26.01 
 
 
505 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  35.26 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  25.82 
 
 
545 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  25.82 
 
 
545 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  26.64 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2403  Ppx/GppA phosphatase  26.32 
 
 
533 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  22.92 
 
 
524 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  23.55 
 
 
497 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  26.3 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  25.08 
 
 
545 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  26.15 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  25.33 
 
 
548 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.17 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.23 
 
 
500 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  26.86 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  26.49 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  24.51 
 
 
550 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  26.14 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25.08 
 
 
531 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.99 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  27.37 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.41 
 
 
524 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  24.2 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  27.84 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  24.61 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  26.09 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  25.83 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.36 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.36 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.36 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.36 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  24.03 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.33 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.23 
 
 
523 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  25.66 
 
 
531 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  24.01 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
519 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  26.37 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.95 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  26.47 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  25.32 
 
 
539 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  25.82 
 
 
500 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  26.51 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.92 
 
 
512 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  22.7 
 
 
512 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  25.25 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.23 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  25.16 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  24.84 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  26.49 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 
512 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  27.17 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  23.08 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  26.79 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  26.86 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  24.67 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  28.8 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  25.93 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  24.04 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  24.04 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  24.04 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>