More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1741 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  100 
 
 
307 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  78.4 
 
 
304 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  63.79 
 
 
303 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  60.93 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  60.93 
 
 
300 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  58.22 
 
 
311 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  58.09 
 
 
311 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  42 
 
 
308 aa  215  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  37.75 
 
 
305 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  38.68 
 
 
441 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  37.13 
 
 
318 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  37.34 
 
 
313 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  38.44 
 
 
312 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 
303 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  37.33 
 
 
296 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  34.34 
 
 
301 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  37.34 
 
 
435 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 
319 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  35.94 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  36.76 
 
 
367 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  37.33 
 
 
312 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 
314 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  36.34 
 
 
376 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  35.87 
 
 
520 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  37.74 
 
 
318 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  34.22 
 
 
513 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
288 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  35.45 
 
 
308 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  38.05 
 
 
307 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  35.37 
 
 
446 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
353 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  36.22 
 
 
323 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  35.33 
 
 
498 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  36.54 
 
 
357 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  34.92 
 
 
326 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  37.22 
 
 
399 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  39.46 
 
 
310 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  35.33 
 
 
498 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.34 
 
 
305 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
511 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  34.33 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  36.27 
 
 
513 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  35.39 
 
 
510 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  33.98 
 
 
312 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  34.54 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  36.74 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  35.46 
 
 
318 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
321 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  36.25 
 
 
355 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 
311 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  39.42 
 
 
353 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
312 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  35.44 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  35.96 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  34.07 
 
 
504 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  36.88 
 
 
338 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 
509 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  38.77 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  35.14 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  35.69 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  33.02 
 
 
375 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  36.13 
 
 
331 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  31.39 
 
 
531 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  33.9 
 
 
500 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  35.62 
 
 
513 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  34.17 
 
 
603 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  31.6 
 
 
531 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  34.09 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  32.7 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  38.6 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  37.34 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  33.22 
 
 
500 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
545 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
545 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  36.39 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  37.14 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  35.14 
 
 
501 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  32.39 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
519 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  30.33 
 
 
297 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
318 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  35.44 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  35.87 
 
 
315 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  37.14 
 
 
318 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
319 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.93 
 
 
531 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  34.29 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 
305 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  35.24 
 
 
309 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  35.24 
 
 
309 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
313 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  35.24 
 
 
309 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  34.95 
 
 
315 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>