More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1516 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 376 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  90.17 
 
 		 367 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  72.58 
 
 		 380 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  73.28 
 
 		 375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  73.02 
 
 		 375 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  73.92 
 
 		 360 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  60.73 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  61.8 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  57.8 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  62.28 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  55.26 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  61.44 
 
 		 433 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  55.53 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  57.8 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  59.33 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  57.06 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  58.64 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  57.45 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  57.63 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  56.11 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  57.68 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  55.31 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  53.64 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  50.42 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  55.17 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  56.21 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  46.77 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  46.3 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  43.38 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  43.38 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  43.1 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  43.3 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  42.82 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  48.63 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  48.99 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  45.51 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  43.7 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  44.44 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  45.2 
 
 		 377 aa  243  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  35.31 
 
 		 311 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.27 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.54 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  35.08 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  29.34 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.84 
 
 		 549 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.22 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  35.22 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  36.68 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.94 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.02 
 
 		 311 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 		 500 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  32.31 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  31.13 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.89 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.62 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  32.92 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.53 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.67 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.01 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.85 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.08 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  26.5 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 		 288 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  34.3 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 330 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.22 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  34.15 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  27.41 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  31.27 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.71 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.26 
 
 		 557 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  29.19 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.36 
 
 		 545 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.78 
 
 		 519 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 		 507 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 		 502 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  26.38 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  32.82 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.98 
 
 		 539 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  29.21 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  33.9 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  27.6 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  27.07 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>