More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2550 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 331 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  82.93 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  75.47 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  72.59 
 
 		 366 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  71.03 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  72.56 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  73.73 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  60.18 
 
 		 504 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  59.38 
 
 		 498 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  60.57 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  57.94 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  59.94 
 
 		 520 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  59.06 
 
 		 498 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  57.74 
 
 		 603 aa  355  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  57.86 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 		 375 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 		 375 aa  348  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  57.68 
 
 		 376 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  58.1 
 
 		 413 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  56.84 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  56.89 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  59.01 
 
 		 509 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  57.46 
 
 		 360 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  55.32 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  53.96 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  49.4 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  54.46 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  48.89 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  47.81 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  50.32 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  48.26 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  44.15 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  42.94 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  43.44 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  42.86 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.36 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  43.35 
 
 		 393 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  45.6 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  44.17 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  34.52 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.08 
 
 		 523 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  32.08 
 
 		 513 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  35.92 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.59 
 
 		 500 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 		 513 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  28.76 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  29.68 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.81 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  32.59 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  32.13 
 
 		 500 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.58 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  28.99 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  35.66 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 		 570 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  34.32 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  34.01 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  36.13 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  29.03 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.65 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.69 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 		 511 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.89 
 
 		 510 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.3 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.62 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 		 519 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  32.08 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.5 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.43 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.9 
 
 		 545 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  28.3 
 
 		 539 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  34.14 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.82 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  27.45 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  27.6 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  32.9 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  32.49 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  29.02 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  35.52 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  25.82 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  26.86 
 
 		 501 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>