More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1413 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  99.74 
 
 
378 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  97.09 
 
 
378 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
378 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  75.93 
 
 
370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  82.23 
 
 
393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  72.34 
 
 
393 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  75.53 
 
 
374 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  47.63 
 
 
520 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  44.41 
 
 
446 aa  275  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  45.85 
 
 
413 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  43.99 
 
 
498 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  43.99 
 
 
498 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  43.4 
 
 
504 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  43.14 
 
 
375 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  43.75 
 
 
603 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  42.45 
 
 
375 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  43.35 
 
 
380 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  42.74 
 
 
367 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  43.64 
 
 
375 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  43.95 
 
 
376 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  42.69 
 
 
435 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  44.14 
 
 
360 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  44.02 
 
 
357 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  42.11 
 
 
441 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  42.39 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  40.22 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  43.47 
 
 
509 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  41.52 
 
 
399 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  44.44 
 
 
325 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  42.82 
 
 
389 aa  252  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  40.63 
 
 
366 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  41.01 
 
 
355 aa  249  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 
331 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  42.69 
 
 
378 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 
355 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  42.49 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  39.61 
 
 
363 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  40.12 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  29.94 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
305 aa  126  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  29.74 
 
 
513 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
550 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.12 
 
 
549 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.75 
 
 
539 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  31.49 
 
 
311 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.91 
 
 
532 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  24.7 
 
 
300 aa  116  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.59 
 
 
513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.74 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.58 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.48 
 
 
545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.2 
 
 
491 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  28.87 
 
 
308 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.39 
 
 
544 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.39 
 
 
544 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.61 
 
 
513 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 
505 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.03 
 
 
568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  29.09 
 
 
501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  27.43 
 
 
570 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  25.8 
 
 
550 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  28.44 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 
505 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.41 
 
 
498 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.7 
 
 
500 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.44 
 
 
500 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  31.17 
 
 
330 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.03 
 
 
498 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
307 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.11 
 
 
520 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 
545 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 
545 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  32.03 
 
 
321 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.38 
 
 
507 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  28.27 
 
 
520 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
501 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.05 
 
 
510 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  29.36 
 
 
511 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  26.09 
 
 
508 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.66 
 
 
498 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.43 
 
 
296 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  39.61 
 
 
502 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  23.89 
 
 
531 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.31 
 
 
498 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.31 
 
 
498 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.31 
 
 
498 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25 
 
 
531 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 
326 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  31.08 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  24.86 
 
 
531 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  29.08 
 
 
318 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  29.64 
 
 
314 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 
303 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 
303 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  27.81 
 
 
303 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  30.95 
 
 
311 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  26.25 
 
 
509 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>