More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1183 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 370 aa  755    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  75.93 
 
 		 378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  75.93 
 
 		 378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  75.66 
 
 		 378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  77.56 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  72.26 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  73.37 
 
 		 374 aa  524  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  44.44 
 
 		 446 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  45.51 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  42.47 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  43.42 
 
 		 498 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  43.42 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  43.66 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  45.45 
 
 		 520 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  45.13 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  43.33 
 
 		 375 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  42.9 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  42.94 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  40.82 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  40.38 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  42.86 
 
 		 603 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  41.33 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  43.9 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  41.5 
 
 		 441 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  41.94 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  44.16 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  43.17 
 
 		 355 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  40.82 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  40.5 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  41.46 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  41.57 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  43.32 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  43.79 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  39.51 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  41.4 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  39.44 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  40.88 
 
 		 377 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.4 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.52 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  27.61 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.74 
 
 		 532 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  26.67 
 
 		 549 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.07 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 		 505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 545 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.82 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.38 
 
 		 513 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  27.62 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.4 
 
 		 500 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.2 
 
 		 570 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  23.96 
 
 		 531 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  28.32 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  29.43 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.7 
 
 		 507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.12 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.86 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.61 
 
 		 544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  30.9 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.61 
 
 		 544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25.36 
 
 		 531 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.21 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.47 
 
 		 498 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.17 
 
 		 520 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  25.14 
 
 		 550 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  24.71 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  24.78 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  28.85 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  25.57 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.86 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  25.57 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  27.36 
 
 		 501 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  27.19 
 
 		 288 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  24.22 
 
 		 531 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  29.85 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.65 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.36 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.99 
 
 		 498 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  31.55 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  29.65 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  28.18 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30.38 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  29.36 
 
 		 511 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 		 500 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.45 
 
 		 513 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 		 544 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  29.88 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  31.5 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.32 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  29.75 
 
 		 305 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  30.79 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.07 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.56 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.83 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>