More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3082 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 366 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  75.62 
 
 		 355 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  74.12 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  79.5 
 
 		 325 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  69.42 
 
 		 357 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  72.59 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  71.2 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  53.33 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  57.31 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  58.02 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  53.52 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  57.8 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  55.83 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  53.52 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  57.19 
 
 		 498 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  58.39 
 
 		 603 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  58.44 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  58.51 
 
 		 413 aa  345  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  54.47 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  55.93 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  55.35 
 
 		 376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  55.46 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  59.13 
 
 		 509 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  50.83 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  55.35 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  53.57 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  46.93 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  48.3 
 
 		 435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  51.99 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  48.44 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  48.9 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  40.96 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  42.37 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  40.8 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  39.95 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  40.63 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  40.82 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  40.63 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  43.65 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  41.18 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  32.8 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  34.37 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  30.65 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  30.75 
 
 		 523 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.49 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 		 511 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.66 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  34.04 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.52 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.91 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  35.58 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.27 
 
 		 500 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  32.28 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  30.42 
 
 		 491 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 		 307 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  35.83 
 
 		 304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  26.9 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.35 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 		 519 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  35.96 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  35.41 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 		 545 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 		 545 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.27 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  31.39 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 		 505 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.18 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  28.22 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.24 
 
 		 507 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 		 501 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 		 311 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 		 550 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  34.46 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  34.48 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  29.11 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  27.66 
 
 		 516 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 502 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  30.13 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.86 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  32.64 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.1 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  28.03 
 
 		 513 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  30.31 
 
 		 505 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>