More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3742 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
375 aa  742    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  97.11 
 
 
380 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  99.73 
 
 
375 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  81.33 
 
 
360 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  73.46 
 
 
376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  75.64 
 
 
367 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  58.73 
 
 
520 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  61.38 
 
 
498 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  59.59 
 
 
504 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  60.78 
 
 
498 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  55.44 
 
 
433 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  53.37 
 
 
441 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  59.34 
 
 
603 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  61.11 
 
 
509 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  53.52 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  60.43 
 
 
413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  58.09 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  57.14 
 
 
389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  55.94 
 
 
357 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  57.37 
 
 
355 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  55.62 
 
 
355 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 
331 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 
325 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  53.52 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  55.79 
 
 
358 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  49.55 
 
 
375 aa  305  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  47.2 
 
 
373 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  50.48 
 
 
399 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  43.77 
 
 
393 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  46.61 
 
 
355 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  45.33 
 
 
435 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  42.01 
 
 
393 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 
374 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  43.55 
 
 
378 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  43.43 
 
 
378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  43.43 
 
 
378 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  45.83 
 
 
363 aa  266  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  45.23 
 
 
364 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
370 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  43.48 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  34.17 
 
 
500 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  33.77 
 
 
500 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.41 
 
 
308 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  34.17 
 
 
311 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.82 
 
 
303 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.18 
 
 
549 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.6 
 
 
513 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  29.26 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.91 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  27.91 
 
 
305 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
300 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  32.6 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.73 
 
 
300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.97 
 
 
513 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  33.02 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 
545 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 
545 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 
519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
307 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
502 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 
511 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.5 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  32.14 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 
502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  34.13 
 
 
330 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  31.6 
 
 
311 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  31.07 
 
 
548 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.9 
 
 
301 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 
326 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  29.73 
 
 
318 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 
319 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
501 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  32.65 
 
 
321 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
312 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 
523 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.91 
 
 
539 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  31.89 
 
 
312 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  30 
 
 
545 aa  106  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.39 
 
 
507 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.45 
 
 
550 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  26.42 
 
 
506 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
570 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  28.26 
 
 
319 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
353 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  31.97 
 
 
353 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 
520 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.47 
 
 
531 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.05 
 
 
498 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  27.71 
 
 
544 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
491 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.05 
 
 
498 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>