More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2753 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
363 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  65.86 
 
 
435 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  63.43 
 
 
355 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  46.33 
 
 
373 aa  282  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
446 aa  278  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  52.5 
 
 
399 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  48.6 
 
 
498 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  48.29 
 
 
498 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  50.16 
 
 
355 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  48.15 
 
 
433 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 
355 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  44.69 
 
 
504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  47.71 
 
 
520 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  49.52 
 
 
603 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  47.18 
 
 
413 aa  266  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  48.9 
 
 
366 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
357 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  48.07 
 
 
367 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  50.32 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  48.74 
 
 
376 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  45.83 
 
 
375 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  43.94 
 
 
375 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  43.62 
 
 
380 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  48.75 
 
 
325 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  43.54 
 
 
364 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  45.43 
 
 
441 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  45.38 
 
 
509 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  47.44 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  40.95 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  39.61 
 
 
378 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  48.56 
 
 
358 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  39.61 
 
 
378 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  41.4 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.21 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  45.29 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  40.34 
 
 
374 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  41.74 
 
 
393 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  46.11 
 
 
377 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  44.23 
 
 
389 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
507 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.94 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  31.51 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  32.38 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  36.96 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 
318 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  33.97 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  32.42 
 
 
513 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
545 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
545 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  35.26 
 
 
311 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 
310 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  34.78 
 
 
319 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  35.74 
 
 
321 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  33.86 
 
 
511 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  34.42 
 
 
303 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.71 
 
 
300 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.12 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.12 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.13 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 
491 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29.68 
 
 
519 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  34.88 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.06 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.68 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  34.16 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  36.74 
 
 
307 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  30.75 
 
 
570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  29.94 
 
 
544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.81 
 
 
550 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
500 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  32.54 
 
 
331 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 
513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  32.28 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 
318 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  32.99 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  35.96 
 
 
330 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  32.36 
 
 
501 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  32.79 
 
 
532 aa  112  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
526 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
526 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
526 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
526 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.5 
 
 
550 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.76 
 
 
300 aa  112  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  36.14 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.13 
 
 
532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  29.14 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  34.28 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  30.77 
 
 
545 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.34 
 
 
520 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.2 
 
 
557 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
509 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 
502 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>