More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0246 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 399 aa  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  52.91 
 
 		 446 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  50.15 
 
 		 603 aa  299  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  51.99 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  48.48 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 		 520 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  47.08 
 
 		 504 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  51.11 
 
 		 380 aa  282  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  48.9 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  49.22 
 
 		 355 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  50.48 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  50.48 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  49.38 
 
 		 357 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  52.5 
 
 		 363 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  48.57 
 
 		 498 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  47.51 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  48.25 
 
 		 498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  49.69 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  49.07 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  48.89 
 
 		 331 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  48.97 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  49.12 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  46.91 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  50.76 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  48.62 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  48.6 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  45.65 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  43.26 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  44.06 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  46.73 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  46.69 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  41.52 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  41.52 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  41.52 
 
 		 378 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  39.51 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.84 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  43.41 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  40.06 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  37.22 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  37.94 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  36.28 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 		 318 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  30.15 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.77 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 511 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.91 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  33.94 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  35.67 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  34.05 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  34.32 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  35.49 
 
 		 314 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  33.53 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.66 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  37.58 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.85 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  35.15 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  34.38 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  33.02 
 
 		 313 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.97 
 
 		 513 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  37.22 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  35.95 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  34.31 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  36.53 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.44 
 
 		 544 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  33.33 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  32.61 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  37.03 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.59 
 
 		 544 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  27.45 
 
 		 297 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.31 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  35.27 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  30.15 
 
 		 505 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  34.92 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  31.8 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.66 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 		 507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  34.9 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  28.21 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  35.02 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  34.03 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.55 
 
 		 545 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 		 497 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.55 
 
 		 545 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>