More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3197 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 358 aa  708    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  82.63 
 
 		 355 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  91.67 
 
 		 325 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  74.12 
 
 		 366 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  70.34 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  73.73 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  70.4 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  55.78 
 
 		 441 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  58.2 
 
 		 520 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  56.25 
 
 		 504 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  55.04 
 
 		 498 aa  342  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  57.86 
 
 		 433 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  54.76 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  58.18 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  55.18 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  56.29 
 
 		 603 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  55.18 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  55.18 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  57.14 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  56.51 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  55.8 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  56.84 
 
 		 509 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  57.7 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  55.49 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  52.44 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  49.38 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  52.96 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  49.69 
 
 		 435 aa  282  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  49.22 
 
 		 399 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  46.77 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  44.51 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  43.79 
 
 		 393 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  44.08 
 
 		 370 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  42.78 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  43.23 
 
 		 378 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  42.78 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  43.7 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  48.88 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  45.45 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  42.54 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  32.19 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  33.12 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.47 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.01 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  28.53 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 		 510 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.56 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.62 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.37 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29.06 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.32 
 
 		 549 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  35.05 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  33.92 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 		 570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  29.06 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  29.06 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.54 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  33.22 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  35.76 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  32.07 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  29.62 
 
 		 519 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.99 
 
 		 318 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.22 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  25.29 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  25.47 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.5 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.95 
 
 		 545 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  27.03 
 
 		 557 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  34.01 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  32.55 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.48 
 
 		 568 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  25.55 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 		 505 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.53 
 
 		 501 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.25 
 
 		 544 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.25 
 
 		 544 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  31.17 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  25.62 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.79 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  25.6 
 
 		 544 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.94 
 
 		 501 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  27.65 
 
 		 501 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  34.78 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  33.11 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>