More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3920 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 353 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  74.63 
 
 		 318 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  58.38 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  57.36 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  57.53 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  54.79 
 
 		 312 aa  315  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  55.4 
 
 		 331 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  58.11 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  53.64 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  54.93 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  54.36 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  53.53 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  57.7 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  55.13 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  55.19 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  52.8 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  53.24 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  56.23 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  52.65 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  54.46 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  52.27 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  50.72 
 
 		 326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  48.98 
 
 		 319 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  52.06 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  51.33 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  49.27 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  49.4 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  49.28 
 
 		 328 aa  242  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  48.28 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  49.85 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 		 317 aa  232  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  43.11 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  46.06 
 
 		 532 aa  227  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  42.73 
 
 		 568 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  40.74 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  40.39 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  29.23 
 
 		 301 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  32.82 
 
 		 305 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  34.13 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  39.63 
 
 		 305 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  37.76 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  33.43 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  39.02 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.58 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  30.22 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  39.94 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  33.43 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  37.46 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  32.04 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.92 
 
 		 544 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.92 
 
 		 544 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  32.22 
 
 		 312 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.23 
 
 		 545 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  32.73 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0128  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  33.63 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  31.82 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  31.19 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.12 
 
 		 532 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  34.29 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  32.44 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  33.33 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  32.35 
 
 		 505 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.13 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  31.75 
 
 		 548 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.59 
 
 		 550 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.66 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  26.22 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.88 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  29.36 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 		 502 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  30.75 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.29 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  30.63 
 
 		 303 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5174  Ppx/GppA phosphatase  29.48 
 
 		 298 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985402  normal  0.0128836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 		 435 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  30.2 
 
 		 603 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  30.38 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 		 501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.42 
 
 		 505 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  29.03 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.65 
 
 		 550 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03920  exopolyphosphatase  38.1 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.20783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.4 
 
 		 502 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  33.94 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  31.7 
 
 		 498 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.31 
 
 		 553 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  31.41 
 
 		 498 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>