More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0128 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0128  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
347 aa  703    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  37.88 
 
 
310 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03920  exopolyphosphatase  33.24 
 
 
359 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.20783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  35.87 
 
 
327 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 
301 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  33.84 
 
 
312 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  33.24 
 
 
319 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
310 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.71 
 
 
307 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.63 
 
 
318 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  32.02 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  34.44 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
313 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  33.43 
 
 
314 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  30.65 
 
 
305 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.73 
 
 
326 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  33.93 
 
 
320 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  31.71 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  33.92 
 
 
318 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  31.74 
 
 
311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  30.33 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  30.33 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  32.01 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  30.33 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
326 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 
353 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  32.4 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  31.74 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  33.24 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.93 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  29.1 
 
 
317 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  32.4 
 
 
305 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  27.97 
 
 
502 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  30.24 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 
311 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  31.27 
 
 
312 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30.96 
 
 
288 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  29.88 
 
 
319 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  31.58 
 
 
315 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
318 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  31.49 
 
 
328 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  28.82 
 
 
315 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  32.65 
 
 
311 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  30.54 
 
 
330 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  29.76 
 
 
333 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  31.78 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  26.95 
 
 
501 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 
319 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 
315 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.32 
 
 
568 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
303 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  29.85 
 
 
312 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  32.83 
 
 
311 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  29.15 
 
 
513 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 
519 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 
313 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  28 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  33.23 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  32 
 
 
304 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  29.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  26.92 
 
 
501 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  29.23 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  27.71 
 
 
570 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 
513 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  31.17 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  30.07 
 
 
532 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  32.44 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  25.23 
 
 
300 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  27.58 
 
 
557 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  27.84 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  27.13 
 
 
508 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  27.74 
 
 
501 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.57 
 
 
500 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  26.83 
 
 
506 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  26.73 
 
 
501 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  27.94 
 
 
544 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.66 
 
 
550 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  28.83 
 
 
491 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.35 
 
 
500 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 
545 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 
363 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 
545 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  25.39 
 
 
499 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 
502 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.66 
 
 
513 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.75 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  37.06 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  25.54 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  27.05 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  25.85 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>