More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2121 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
338 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  36.74 
 
 
307 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  33.76 
 
 
308 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  33.66 
 
 
321 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 
366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  32.93 
 
 
315 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.73 
 
 
303 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  34.06 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  34.16 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  32.59 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  32.92 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  35.81 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  31.63 
 
 
296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  31.69 
 
 
376 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
363 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  32.59 
 
 
312 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  37.82 
 
 
307 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  32.61 
 
 
375 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  32.61 
 
 
375 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  33.75 
 
 
311 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  32.62 
 
 
367 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  31.79 
 
 
355 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  33.75 
 
 
360 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  36.39 
 
 
317 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 
353 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  35.81 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  31.55 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  32.14 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  34.36 
 
 
330 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 
301 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  32.32 
 
 
319 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  29.57 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.46 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  31.15 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  32.2 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  31.15 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  31.73 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  34.3 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  29.3 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 
355 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  35.81 
 
 
305 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  31.9 
 
 
603 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  30.72 
 
 
331 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.34 
 
 
326 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
550 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  29.34 
 
 
498 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  30.31 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  30.31 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  30.31 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  32.49 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.86 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.22 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 
557 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  28.4 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  29.04 
 
 
498 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  26.02 
 
 
317 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  32.18 
 
 
308 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  29.19 
 
 
413 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
570 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  30.63 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  28.32 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  27.54 
 
 
378 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 
320 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  27.54 
 
 
378 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.27 
 
 
500 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  28.57 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.45 
 
 
532 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  32.82 
 
 
328 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  29.69 
 
 
355 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.07 
 
 
549 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
325 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  26.27 
 
 
299 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  30.96 
 
 
328 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
433 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 
308 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0128  Ppx/GppA phosphatase  27.43 
 
 
347 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
374 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 
311 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.44 
 
 
513 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  30.67 
 
 
331 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 
550 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.4 
 
 
544 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.4 
 
 
544 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.94 
 
 
500 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.34 
 
 
545 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
505 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.13 
 
 
326 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
326 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0093  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 
296 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0133967  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.27 
 
 
303 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  28.35 
 
 
370 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.27 
 
 
545 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
305 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>