More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1297 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1958  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.19 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1713  Ppx/GppA family phosphatase  36.36 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1217  WalN protein  38.16 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1016  Ppx/GppA family phosphatase  36.51 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130411  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1372  Ppx/GppA family phosphatase  32.01 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.535377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1251  Ppx/GppA family phosphatase  31.4 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0489  Ppx/GppA family phosphatase  31.1 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0932  Ppx/GppA phosphatase family superfamily  31.5 
 
 		 321 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.794251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.58 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  29.03 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  28.89 
 
 		 603 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 		 502 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  29.19 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  29.19 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 		 433 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  28.93 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  27.62 
 
 		 435 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  28.05 
 
 		 446 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  27.41 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  27.22 
 
 		 413 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  27.3 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  27.48 
 
 		 504 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  27.3 
 
 		 498 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  27.39 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  27.76 
 
 		 380 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  27.33 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  28.8 
 
 		 357 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  28.02 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  27.44 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  26.76 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  28.06 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  27.92 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 		 519 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  27.61 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  25.32 
 
 		 510 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  25.24 
 
 		 521 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  27.19 
 
 		 509 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 		 358 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  27.62 
 
 		 360 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  27.16 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  23.64 
 
 		 519 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  27.56 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  26.93 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 		 502 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  28.15 
 
 		 501 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.89 
 
 		 513 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  27.04 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.04 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  24.33 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  24.12 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 		 500 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  25.15 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 501 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.64 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.97 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  23.75 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  25.75 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  27.48 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  27.13 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  26.95 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  23.44 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  25.78 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  25.16 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  26.8 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  25.39 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  24.08 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  28.05 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  26.62 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  23.95 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  27.99 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>