259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0932 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0932  Ppx/GppA phosphatase family superfamily  100 
 
 
321 aa  643    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.794251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1372  Ppx/GppA family phosphatase  57.62 
 
 
324 aa  335  9e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.535377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1251  Ppx/GppA family phosphatase  57.62 
 
 
324 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0489  Ppx/GppA family phosphatase  57.01 
 
 
324 aa  325  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1713  Ppx/GppA family phosphatase  39.69 
 
 
284 aa  192  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1958  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.68 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1217  WalN protein  35.06 
 
 
293 aa  155  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1016  Ppx/GppA family phosphatase  34.28 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  31.5 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  22.69 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  22.35 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  22.53 
 
 
520 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  25.15 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  24.32 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  22.12 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  20.9 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  21.84 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  22.32 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  23.6 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.65 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  20.6 
 
 
498 aa  68.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  23.49 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  21.55 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  21.19 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.71 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  22.22 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  22.81 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  21.56 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  22.87 
 
 
603 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  28.92 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  22.38 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  22.94 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  22.38 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  30.5 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  27.04 
 
 
499 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  24.77 
 
 
510 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  24.77 
 
 
511 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  27.38 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  22.94 
 
 
513 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  24.11 
 
 
501 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  22.29 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
518 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  29.34 
 
 
518 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  21.24 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
518 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  22.85 
 
 
377 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
518 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
517 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  21.56 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  29.07 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
506 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  21.01 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  21.08 
 
 
513 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  26.54 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  28.83 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
520 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
520 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
520 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  20.76 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  21.02 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
520 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  29.29 
 
 
499 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  20.43 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  22.06 
 
 
446 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  32.67 
 
 
549 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  24.72 
 
 
491 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  20.71 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  23.21 
 
 
519 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  22.88 
 
 
505 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  28.67 
 
 
553 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  20.56 
 
 
355 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  20.78 
 
 
549 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  21.36 
 
 
373 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  27.75 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  26.16 
 
 
494 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  24.84 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  25.61 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  22.19 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  22.26 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  29.08 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  23.15 
 
 
500 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.16 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  22.61 
 
 
501 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  26.16 
 
 
494 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  24.41 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  20.6 
 
 
393 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  21.21 
 
 
509 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  23.48 
 
 
502 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  22.99 
 
 
500 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  25.58 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>