More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2185 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  86.82 
 
 
517 aa  892    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  100 
 
 
518 aa  1062    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  88.46 
 
 
520 aa  878    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  88.26 
 
 
520 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  88.26 
 
 
520 aa  876    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  88.66 
 
 
520 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  94.21 
 
 
518 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  94.02 
 
 
518 aa  984    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  94.02 
 
 
518 aa  983    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  67.07 
 
 
502 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3078  Ppx/GppA phosphatase  64.51 
 
 
515 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  42.62 
 
 
520 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  41.77 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  41.74 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  41.48 
 
 
511 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  42.01 
 
 
508 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 
500 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  43.37 
 
 
500 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  43.21 
 
 
526 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  40.58 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.07 
 
 
500 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  40.73 
 
 
500 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  40.37 
 
 
513 aa  346  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  40.37 
 
 
513 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  40.86 
 
 
500 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  41.55 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  39.96 
 
 
497 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.28 
 
 
501 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  39.84 
 
 
500 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  40.95 
 
 
513 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
501 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  38.66 
 
 
500 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
526 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.72 
 
 
513 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  43.29 
 
 
500 aa  339  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  41.53 
 
 
519 aa  339  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  41.53 
 
 
519 aa  339  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  41.32 
 
 
519 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  40.12 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  39.3 
 
 
501 aa  336  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  37.7 
 
 
509 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  40.86 
 
 
500 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
516 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40 
 
 
498 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  36.49 
 
 
516 aa  329  8e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  40.25 
 
 
501 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.17 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  39.36 
 
 
501 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.35 
 
 
498 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.17 
 
 
500 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  41.67 
 
 
494 aa  325  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  324  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
494 aa  324  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  43.34 
 
 
505 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  41.67 
 
 
494 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  41.67 
 
 
494 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
493 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
493 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  41.55 
 
 
499 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.94 
 
 
498 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.94 
 
 
498 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.94 
 
 
498 aa  312  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.22 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  38.37 
 
 
508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  38.32 
 
 
509 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  38.21 
 
 
503 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  41.44 
 
 
508 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  37.24 
 
 
499 aa  300  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 
506 aa  299  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  36.63 
 
 
503 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  40.96 
 
 
499 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  40.78 
 
 
501 aa  297  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  36.6 
 
 
512 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.41 
 
 
497 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.02 
 
 
497 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  36.58 
 
 
499 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  37.91 
 
 
520 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  36.29 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  36.09 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  36.09 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  36.09 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  36.09 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>