More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4143 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  99.39 
 
 		 494 aa  1002    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  99.6 
 
 		 494 aa  1006    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 498 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  89.41 
 
 		 493 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  72.91 
 
 		 498 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 498 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.54 
 
 		 498 aa  745    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  99.39 
 
 		 494 aa  1003    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  77.44 
 
 		 498 aa  790    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  99.6 
 
 		 494 aa  1006    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 498 aa  754    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  89.61 
 
 		 493 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  100 
 
 		 494 aa  1011    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  73.52 
 
 		 500 aa  731    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  99.6 
 
 		 494 aa  1006    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  99.39 
 
 		 494 aa  1002    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  85.6 
 
 		 495 aa  863    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  99.6 
 
 		 494 aa  1006    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  99.39 
 
 		 494 aa  1003    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  73.12 
 
 		 498 aa  741    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  89.61 
 
 		 493 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  89.61 
 
 		 493 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  89.41 
 
 		 493 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.82 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 		 497 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  52.39 
 
 		 439 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  46.91 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  47.22 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  40.04 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  40.41 
 
 		 520 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  41.18 
 
 		 500 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  39.19 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  39.71 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  41.19 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  39.26 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.39 
 
 		 501 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.76 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  39.88 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  39.32 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  39.92 
 
 		 509 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.75 
 
 		 519 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.75 
 
 		 519 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.43 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  38.8 
 
 		 500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 526 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  38.8 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  39.18 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  38.8 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  39.75 
 
 		 516 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  39.39 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  39.71 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.67 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.24 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.97 
 
 		 526 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.59 
 
 		 513 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.59 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  42.93 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  38.27 
 
 		 502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  37.88 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  39 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  41.67 
 
 		 518 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  42.68 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  42.68 
 
 		 520 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  39.47 
 
 		 497 aa  322  9.000000000000001e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  42.43 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  39.08 
 
 		 508 aa  320  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  39.32 
 
 		 508 aa  319  9e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  42.08 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  36.31 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 		 499 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  39.67 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  37.85 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 		 506 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  40.09 
 
 		 518 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 		 518 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  38.78 
 
 		 501 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  39.64 
 
 		 509 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  37.27 
 
 		 504 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>