More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0739 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  65.27 
 
 		 513 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  62.6 
 
 		 522 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  66.6 
 
 		 513 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  65.07 
 
 		 548 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  65.07 
 
 		 513 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  61.62 
 
 		 513 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  61.62 
 
 		 513 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 506 aa  1021    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  37.01 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  39.3 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  37.04 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 		 533 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  37.6 
 
 		 517 aa  273  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  37.6 
 
 		 517 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  37.6 
 
 		 517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  35.43 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  36.04 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  36.33 
 
 		 513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  32.99 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  36.02 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  35.76 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  35.36 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  34.37 
 
 		 512 aa  253  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  38.06 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  35.31 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  32.78 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  34.62 
 
 		 503 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  34.3 
 
 		 529 aa  250  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  31.94 
 
 		 506 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  34.86 
 
 		 501 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  35.7 
 
 		 501 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  33.06 
 
 		 512 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  33.47 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  35.82 
 
 		 498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  32.85 
 
 		 512 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  34.23 
 
 		 501 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  37.17 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  31.73 
 
 		 491 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  27.82 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.01 
 
 		 502 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.81 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.41 
 
 		 539 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.77 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.32 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.06 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.89 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  26.03 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  25.73 
 
 		 519 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  27.02 
 
 		 501 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  25.56 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  26.54 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  25.56 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.11 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  24.08 
 
 		 524 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.25 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  25.71 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  23.81 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  26.86 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.5 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  25.95 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  24.83 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  26.65 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  26.65 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  25.95 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.94 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  25.46 
 
 		 482 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  26.37 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  25.73 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.4 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  24.79 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.29 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.33 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  26.1 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.35 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.29 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.29 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.29 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.29 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  23.98 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  25.21 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  25.21 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  23.17 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  24.77 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  26.75 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  24.6 
 
 		 570 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  24.19 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  25.87 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  22.4 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  26.85 
 
 		 303 aa  94.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  23.69 
 
 		 544 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>