More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2114 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  72.78 
 
 
499 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  84.8 
 
 
529 aa  853    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  77.91 
 
 
501 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  79.52 
 
 
501 aa  789    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  78.02 
 
 
501 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
503 aa  1008    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  75.94 
 
 
501 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  57.49 
 
 
503 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  50.99 
 
 
505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  53.18 
 
 
513 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 
517 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  53.07 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  51.33 
 
 
523 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  49.59 
 
 
512 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  48.97 
 
 
512 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  48.97 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  46.64 
 
 
506 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  50.2 
 
 
517 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  50.2 
 
 
517 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  50.41 
 
 
517 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  44.47 
 
 
506 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  43.85 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  41.8 
 
 
506 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  44.03 
 
 
507 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  43.7 
 
 
498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  39.96 
 
 
509 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  38.4 
 
 
533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  34.75 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  36.2 
 
 
513 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  36.51 
 
 
502 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
513 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
513 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  32.23 
 
 
513 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  32.23 
 
 
513 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  34.64 
 
 
522 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  37.66 
 
 
498 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 
548 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 
506 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  36.76 
 
 
499 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  38.45 
 
 
495 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 
500 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  26.09 
 
 
502 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.36 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.06 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  24.51 
 
 
506 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  25.98 
 
 
497 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  29.38 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  26.33 
 
 
502 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  29.17 
 
 
417 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  28.11 
 
 
505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  27.81 
 
 
491 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.56 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  24.74 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.14 
 
 
489 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.94 
 
 
524 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.15 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.97 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.79 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25.6 
 
 
512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.79 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.67 
 
 
524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.46 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  29.45 
 
 
303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.6 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25.6 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.6 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.6 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.94 
 
 
531 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  25.11 
 
 
524 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.15 
 
 
512 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.03 
 
 
482 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 
519 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  26.4 
 
 
550 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.91 
 
 
510 aa  106  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.61 
 
 
531 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  26.35 
 
 
488 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.72 
 
 
513 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  26.4 
 
 
326 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.22 
 
 
502 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.13 
 
 
545 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.98 
 
 
531 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  26.69 
 
 
501 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.18 
 
 
502 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  26.64 
 
 
307 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10492  retrograde regulation protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_6G08350)  26.08 
 
 
574 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.854567 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  28.38 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  24.76 
 
 
492 aa  99.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  26.76 
 
 
301 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  25.61 
 
 
482 aa  99  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  26.65 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.48 
 
 
548 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.53 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 
544 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  24.51 
 
 
545 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  28.96 
 
 
549 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  24.51 
 
 
545 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  28.17 
 
 
308 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.12 
 
 
513 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>