More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0796 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 507 aa  1029    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  70.55 
 
 		 506 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  71.15 
 
 		 506 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  70.55 
 
 		 506 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  56.94 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  57.52 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  57.11 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  53.82 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  49.8 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  48.56 
 
 		 517 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  49.28 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  49.28 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  49.28 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  45.45 
 
 		 529 aa  432  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  45.57 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  49.59 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  49.7 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  45.29 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  44.2 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  44.03 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  45.59 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  44.15 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  45.9 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  44.2 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  43.21 
 
 		 498 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  39.34 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  36.73 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  35.88 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  35.88 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  34.73 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  35.43 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  37.19 
 
 		 499 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  34.31 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 		 548 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  33.82 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  35.73 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  35.28 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 		 498 aa  247  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  35.96 
 
 		 495 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  34.28 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.47 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  26.62 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.85 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.03 
 
 		 513 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.32 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  30.07 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.21 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.8 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  28.09 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  28.09 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  28.09 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  23.77 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 		 417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.23 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  25.06 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  28.48 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  25.19 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.08 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  26.35 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.14 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  27.27 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  27.08 
 
 		 511 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.46 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.22 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  25.71 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  26.01 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  26.95 
 
 		 545 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.95 
 
 		 545 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  25.65 
 
 		 307 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 557 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  27.3 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  23.61 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  25.64 
 
 		 323 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.18 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.18 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 		 309 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 		 309 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 		 309 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 		 322 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  26.28 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.45 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  26.92 
 
 		 301 aa  100  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  25.62 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25.43 
 
 		 301 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  26.02 
 
 		 539 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  24.48 
 
 		 544 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10492  retrograde regulation protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_6G08350)  27.22 
 
 		 574 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.854567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 		 318 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  26.63 
 
 		 531 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  25.62 
 
 		 505 aa  96.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  20.16 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  25.69 
 
 		 570 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  26.1 
 
 		 353 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>