More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1593 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  72.69 
 
 
501 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
529 aa  1066    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  73.9 
 
 
501 aa  752    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  75.5 
 
 
501 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  71.63 
 
 
499 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  74.4 
 
 
501 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  84.8 
 
 
503 aa  853    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  56.15 
 
 
503 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  49.22 
 
 
505 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  47.67 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  51.62 
 
 
513 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  48.88 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  51.64 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  48.38 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  48.39 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  49.19 
 
 
523 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  47.79 
 
 
512 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  44.35 
 
 
506 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  48.98 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  49.18 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  49.18 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  43.64 
 
 
506 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  43 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  45.45 
 
 
507 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 
498 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  38.14 
 
 
509 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  35.83 
 
 
499 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  37.19 
 
 
533 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  35.58 
 
 
513 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  34.98 
 
 
513 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 
513 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 
513 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  34.57 
 
 
513 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
499 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  35.36 
 
 
548 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  34.1 
 
 
506 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  34.39 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
498 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  36.85 
 
 
495 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  26.75 
 
 
506 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.01 
 
 
500 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.61 
 
 
501 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.12 
 
 
500 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  23.04 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.14 
 
 
491 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  29.79 
 
 
420 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.74 
 
 
497 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  27.25 
 
 
502 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  25.99 
 
 
489 aa  120  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.4 
 
 
520 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  25.85 
 
 
492 aa  117  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.65 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.46 
 
 
326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.7 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  29.6 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  29.6 
 
 
544 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.21 
 
 
505 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
301 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  23.76 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  27.94 
 
 
307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.07 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.87 
 
 
512 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.28 
 
 
524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.87 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.87 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.87 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  26.44 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.87 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.7 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.33 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 
417 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.87 
 
 
512 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.57 
 
 
510 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.27 
 
 
511 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  24.07 
 
 
501 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.29 
 
 
502 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.16 
 
 
531 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.55 
 
 
531 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  27.95 
 
 
498 aa  106  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.44 
 
 
531 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  24.89 
 
 
550 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  28.16 
 
 
303 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.8 
 
 
531 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  27.62 
 
 
314 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  28.82 
 
 
355 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  24.69 
 
 
482 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 
312 aa  100  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
508 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 
311 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.21 
 
 
545 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 
363 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.56 
 
 
532 aa  97.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  24.94 
 
 
519 aa  97.1  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.35 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>