More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2493 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  86.83 
 
 		 501 aa  887    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  73.9 
 
 		 529 aa  752    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 501 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  73.24 
 
 		 499 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  81.44 
 
 		 501 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  93.01 
 
 		 501 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  77.91 
 
 		 503 aa  791    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  56.91 
 
 		 503 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  51.22 
 
 		 517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  51.55 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  53.93 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  50.1 
 
 		 523 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  52.37 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  50.61 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  48.76 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  50.61 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  48.55 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  48.55 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  50.41 
 
 		 517 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  45.77 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  44.24 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  43.83 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  44.49 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  44.15 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  43.62 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  40.5 
 
 		 509 aa  333  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  39.01 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  36.76 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 		 513 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 		 513 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  34.9 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  35.25 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  34.7 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  35.42 
 
 		 522 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  36.12 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  34.8 
 
 		 506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  36.14 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  37.81 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.67 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 		 507 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  25.8 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.11 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.62 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  25.06 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.29 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.8 
 
 		 501 aa  123  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  28.04 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  24.59 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.58 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  26 
 
 		 489 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 		 323 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.81 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.39 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  23.63 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.83 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.83 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.85 
 
 		 524 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  29.08 
 
 		 303 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.78 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.78 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.78 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.84 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.78 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  25.06 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  29.14 
 
 		 301 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.85 
 
 		 545 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.9 
 
 		 557 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  26.32 
 
 		 321 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.48 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.25 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  26.81 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  28.66 
 
 		 501 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.48 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  23.66 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  24.8 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  26.95 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  27.27 
 
 		 498 aa  99.8  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  25.11 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  25.18 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.22 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  25.37 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.42 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.19 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 		 545 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 		 545 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.24 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.21 
 
 		 498 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  21.22 
 
 		 510 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  29.13 
 
 		 311 aa  96.7  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.53 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 		 511 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>