More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0207 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  67.82 
 
 		 505 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 523 aa  1045    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  56.38 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  57.64 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  51.93 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  56.07 
 
 		 514 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  52.07 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  53.47 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  53.77 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  50.51 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  51.33 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  53.67 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  49.9 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  50.1 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  49.19 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  49.9 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  47.76 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  48.16 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  48.37 
 
 		 512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  46.45 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  45.19 
 
 		 506 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  43.76 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  43.97 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  44.02 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  42.6 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  36.66 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  36.12 
 
 		 513 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  34.58 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  35.91 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  35.22 
 
 		 506 aa  273  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  33.61 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  33.61 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  37.98 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 		 498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  33.67 
 
 		 502 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  36.59 
 
 		 495 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.41 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 		 502 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.73 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  26.05 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  25.79 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.73 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 		 417 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.01 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  22.5 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.82 
 
 		 497 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.81 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  30.27 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  29.49 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.89 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.91 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  26.09 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  25.52 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.06 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.44 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  24.64 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  26.39 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  27.85 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  27.92 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  26.58 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.95 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.95 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  27.24 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  27.61 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  26.16 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  26.17 
 
 		 300 aa  98.6  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  26.36 
 
 		 505 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.87 
 
 		 482 aa  97.8  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  25.51 
 
 		 482 aa  97.4  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  20.15 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.01 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  25.52 
 
 		 550 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  26 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  29.83 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.62 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  24.84 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.51 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  27.39 
 
 		 303 aa  91.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10492  retrograde regulation protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_6G08350)  25.7 
 
 		 574 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.854567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.01 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.01 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  24.79 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  24.16 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.01 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  24.16 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  24.16 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  24.18 
 
 		 314 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.12 
 
 		 531 aa  90.5  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.4 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>