More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4037 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.49 
 
 		 493 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  84.27 
 
 		 498 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  79.48 
 
 		 498 aa  799    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  100 
 
 		 498 aa  1015    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.29 
 
 		 493 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 494 aa  754    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  73.58 
 
 		 495 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  78.99 
 
 		 500 aa  790    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.29 
 
 		 493 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  100 
 
 		 498 aa  1015    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.95 
 
 		 494 aa  755    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  78.18 
 
 		 498 aa  796    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  78.07 
 
 		 498 aa  797    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.29 
 
 		 493 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  100 
 
 		 498 aa  1015    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.08 
 
 		 493 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.95 
 
 		 494 aa  755    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  74.75 
 
 		 494 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.51 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.1 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  52.97 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  46.63 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  46.68 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  39.68 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  40.85 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  42.03 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.87 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  40.65 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  40.65 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  40.45 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  41.58 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  40.16 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  41.06 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.78 
 
 		 501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  40.57 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  40.57 
 
 		 511 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.96 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  40.58 
 
 		 501 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  39.34 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  40.33 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.22 
 
 		 526 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.22 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.22 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.22 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.22 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  38.07 
 
 		 508 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.87 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.08 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 		 500 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.08 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  39.06 
 
 		 500 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.92 
 
 		 501 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  39.06 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  38.85 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  39.38 
 
 		 500 aa  329  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  39.18 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.97 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39.92 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  38.85 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  40.99 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  35.35 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  39.35 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 520 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  35.56 
 
 		 508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  37.11 
 
 		 502 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  37.94 
 
 		 518 aa  312  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  40.81 
 
 		 520 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  41.31 
 
 		 517 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  39.51 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  38.82 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  37.8 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  37.8 
 
 		 504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  38.03 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  38.23 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  36.67 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  38.95 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  37.3 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  39.27 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>