More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1593 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  66.6 
 
 		 513 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  66.67 
 
 		 513 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 513 aa  1038    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 513 aa  1038    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  66.6 
 
 		 513 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  61.63 
 
 		 506 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  58.2 
 
 		 522 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  57.64 
 
 		 548 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  36.31 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  38.18 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  37.76 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  34.69 
 
 		 506 aa  293  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  34.99 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  33.68 
 
 		 506 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  33.95 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  34.64 
 
 		 517 aa  276  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  33.06 
 
 		 506 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  36.65 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 		 514 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  35.88 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 		 501 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  32.23 
 
 		 503 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  37.58 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  31.89 
 
 		 501 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  34.27 
 
 		 498 aa  253  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  31.39 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 523 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  33.47 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  32.32 
 
 		 499 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  33.27 
 
 		 512 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  35.58 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  34.76 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  34.76 
 
 		 517 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  32.52 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  31.48 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  34.46 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.93 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  20.81 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  20.81 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.47 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  27.99 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  27.61 
 
 		 492 aa  125  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.72 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.1 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.87 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  26.72 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  26.72 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  26.72 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  23.05 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.38 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  28.71 
 
 		 482 aa  120  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.06 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.22 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.97 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.28 
 
 		 524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.26 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.52 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  30.75 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  26.86 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  29.14 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.19 
 
 		 511 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.89 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.89 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  22.89 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  22.91 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.89 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.89 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  25.87 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.26 
 
 		 301 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.92 
 
 		 550 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.8 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.39 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.98 
 
 		 570 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  22.75 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.5 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  23.69 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.5 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 		 557 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.53 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  27.08 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 		 311 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 		 500 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.89 
 
 		 539 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>