More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1857 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  63.98 
 
 		 513 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  63.76 
 
 		 513 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  63.96 
 
 		 513 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 548 aa  1114    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  65.21 
 
 		 506 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  64.43 
 
 		 522 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  57.23 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  42.43 
 
 		 502 aa  301  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  36.01 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  37.45 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  34.82 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  35.42 
 
 		 512 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  34.62 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  34.54 
 
 		 506 aa  273  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  36.53 
 
 		 513 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  36.94 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  34.74 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  36.7 
 
 		 503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  36.2 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  33.47 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  35.5 
 
 		 505 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 		 533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  36.59 
 
 		 501 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  37.14 
 
 		 517 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  37.01 
 
 		 517 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  36.65 
 
 		 499 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 		 517 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  38.68 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  35.36 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  35.39 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  36.12 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  36.28 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  33.49 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  39.16 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  32.64 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  36.57 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.14 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.31 
 
 		 501 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.33 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  31.07 
 
 		 489 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.07 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.68 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  25.09 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  27.4 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  27.4 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  27.4 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.57 
 
 		 507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.94 
 
 		 482 aa  120  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  28.05 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  27.86 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 		 417 aa  115  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.41 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.41 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  25.81 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.75 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  24.76 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  25.64 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  23.72 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  24.52 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  26.39 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.25 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.05 
 
 		 482 aa  107  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.37 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  25.57 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  24.29 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  27.5 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.52 
 
 		 512 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  25.96 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  24.4 
 
 		 550 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.13 
 
 		 524 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.61 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.55 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.55 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.55 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.55 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  25.47 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.43 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  29.7 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 		 570 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.34 
 
 		 545 aa  99.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.37 
 
 		 510 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.55 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  25.49 
 
 		 312 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  29.1 
 
 		 303 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.55 
 
 		 544 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  29.23 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  24.83 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  29.17 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  26.16 
 
 		 321 aa  92.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 		 311 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>