More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0039 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 499 aa  987    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  48.47 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  41.58 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  38.64 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  39.04 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  38.18 
 
 		 513 aa  299  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  38.18 
 
 		 513 aa  299  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  35.83 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  39.33 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  37.47 
 
 		 517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  36.7 
 
 		 498 aa  282  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  36.61 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  36.98 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  37.73 
 
 		 503 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  37.87 
 
 		 506 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  37 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  34.75 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 		 499 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  37.41 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  34.74 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  41.2 
 
 		 512 aa  269  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  40.72 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  40.72 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 		 501 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  37.93 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 		 505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  35.52 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  37.24 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  34.58 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  38.76 
 
 		 495 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  36.66 
 
 		 517 aa  246  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  36.68 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  37.19 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  32.91 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  32.16 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  27.45 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.08 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  33.02 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  30.67 
 
 		 491 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  32.06 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  26.59 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  29.77 
 
 		 326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  30.36 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  31.85 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  31.15 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.88 
 
 		 507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  26.84 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.13 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.04 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.04 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.03 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.03 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.03 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.03 
 
 		 512 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  31.13 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  29.57 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.21 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  31.48 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  29.7 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  30.82 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  26.61 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  29.64 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 		 301 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 		 489 aa  115  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  30.49 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.44 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.83 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.62 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.52 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  26.91 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  26.91 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  26.91 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  28.4 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  26.46 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  27.01 
 
 		 321 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  26.95 
 
 		 307 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 311 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 		 323 aa  107  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 		 505 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  25.94 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  29.1 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.17 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  30.59 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  30.59 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.58 
 
 		 482 aa  105  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  29.1 
 
 		 544 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  27.49 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>