More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5542 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  88.72 
 
 		 513 aa  866    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  72.51 
 
 		 517 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  73.12 
 
 		 517 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  72.1 
 
 		 517 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 514 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  72.56 
 
 		 517 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  60.99 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  57.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  56.07 
 
 		 523 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  53.39 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  52.48 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  53.07 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  52.24 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  53.14 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  52.03 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  51.64 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  52.58 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  51.83 
 
 		 512 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  52.37 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  50.1 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  49.29 
 
 		 506 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  49.29 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  53.21 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  49.7 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  44.49 
 
 		 498 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  36.94 
 
 		 548 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  38.1 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  37.93 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  35.55 
 
 		 506 aa  266  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  38.02 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  39.1 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  36.92 
 
 		 533 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  36.55 
 
 		 498 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  39.14 
 
 		 495 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  37.38 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  26.87 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.93 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.21 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.26 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.63 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 		 489 aa  123  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  24.12 
 
 		 486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  24.02 
 
 		 486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.27 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.03 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  28.99 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.27 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  24.12 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.86 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  20.87 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 		 323 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.23 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.02 
 
 		 557 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  24.39 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  30.2 
 
 		 301 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.77 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.77 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.77 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.46 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.77 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.77 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.97 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.66 
 
 		 531 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  26.32 
 
 		 420 aa  107  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  25.54 
 
 		 500 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  24.11 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.15 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  29.22 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  20 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  20.25 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.69 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.94 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  27.33 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  27.03 
 
 		 549 aa  103  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  23.35 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  25.48 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  27.76 
 
 		 312 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  24.83 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  24.67 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  24.76 
 
 		 321 aa  95.1  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  22.81 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.94 
 
 		 545 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 		 510 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.46 
 
 		 544 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.48 
 
 		 513 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.46 
 
 		 544 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  25.86 
 
 		 511 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>