More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3848 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  71.63 
 
 
529 aa  737    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  73.24 
 
 
501 aa  748    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  74.9 
 
 
501 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
499 aa  999    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  73.17 
 
 
501 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  72.78 
 
 
503 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  72.49 
 
 
501 aa  742    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  55.97 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  49.8 
 
 
517 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  54.36 
 
 
513 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  51.2 
 
 
505 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  49.9 
 
 
523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  53.21 
 
 
514 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  49.28 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  49.48 
 
 
512 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  49.07 
 
 
512 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  52.36 
 
 
517 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  48.76 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  52.36 
 
 
517 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  46.52 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  46.01 
 
 
506 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  51.75 
 
 
517 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  45.79 
 
 
506 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  45.59 
 
 
507 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  44.72 
 
 
498 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  38.72 
 
 
509 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  38.1 
 
 
533 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
499 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  36.55 
 
 
513 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  36.94 
 
 
502 aa  272  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 
513 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 
513 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  36.38 
 
 
522 aa  266  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  36.65 
 
 
548 aa  259  8e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  32.32 
 
 
513 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  32.32 
 
 
513 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  35.11 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  37.68 
 
 
499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  37.45 
 
 
498 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  37.65 
 
 
495 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  27.05 
 
 
506 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.47 
 
 
497 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 
501 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
500 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.62 
 
 
507 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.64 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 
502 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  26.99 
 
 
502 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.96 
 
 
491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  29.27 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.33 
 
 
510 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  31.07 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.31 
 
 
488 aa  117  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  22.94 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
301 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  24.29 
 
 
512 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  22.88 
 
 
524 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
321 aa  115  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.74 
 
 
512 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.74 
 
 
512 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.74 
 
 
512 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.74 
 
 
512 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.05 
 
 
505 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  26.43 
 
 
482 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.36 
 
 
502 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.54 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.6 
 
 
502 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.88 
 
 
544 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.88 
 
 
544 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.39 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.35 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 
520 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  28.81 
 
 
498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.49 
 
 
532 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  27.9 
 
 
312 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.77 
 
 
512 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.06 
 
 
524 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.56 
 
 
557 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  24.62 
 
 
482 aa  109  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.88 
 
 
513 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  28.67 
 
 
303 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  28.05 
 
 
307 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  25.89 
 
 
550 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  28.07 
 
 
549 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.23 
 
 
545 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  26.97 
 
 
489 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  29.13 
 
 
311 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 
363 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  29.35 
 
 
548 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  25.65 
 
 
486 aa  100  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  25.65 
 
 
486 aa  99.8  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  25.65 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.65 
 
 
501 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  24.63 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.76 
 
 
531 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  27.96 
 
 
531 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.97 
 
 
531 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  25.62 
 
 
545 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  25.62 
 
 
545 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>