More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0472 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
311 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  80 
 
 
322 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  61.49 
 
 
311 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  59.8 
 
 
310 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8357  Ppx/GppA phosphatase  58.71 
 
 
309 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  58.71 
 
 
326 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  54.58 
 
 
344 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3352  Ppx/GppA phosphatase  55.84 
 
 
348 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.446334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  56.86 
 
 
339 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0475  Ppx/GppA phosphatase  55.66 
 
 
311 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  54.25 
 
 
324 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3147  Ppx/GppA phosphatase  55.52 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.75368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0406  Ppx/GppA phosphatase  55.59 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0339  Ppx/GppA phosphatase  55.41 
 
 
314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  51.63 
 
 
343 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  53.05 
 
 
314 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  51.96 
 
 
355 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  50.98 
 
 
319 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  51.63 
 
 
323 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18070  Ppx/GppA phosphatase  49.35 
 
 
340 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1920  exopolyphosphatase  47.06 
 
 
322 aa  265  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4595  Ppx/GppA phosphatase  51.45 
 
 
320 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3233  Ppx/GppA phosphatase  52.26 
 
 
308 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5094  Ppx/GppA phosphatase  41.25 
 
 
304 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  38.33 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  35.71 
 
 
513 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  35.11 
 
 
549 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  35.05 
 
 
513 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  31.86 
 
 
557 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
513 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
534 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  31.45 
 
 
550 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  32.81 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  31.01 
 
 
550 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  34.62 
 
 
511 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  34.94 
 
 
510 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  31.61 
 
 
519 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.41 
 
 
307 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  33.77 
 
 
505 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
553 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  29.15 
 
 
544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.3 
 
 
531 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
549 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.81 
 
 
531 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 
501 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 
502 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
502 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  29.81 
 
 
531 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.19 
 
 
539 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  29.13 
 
 
531 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  27.85 
 
 
521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  29.64 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.28 
 
 
544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  27.64 
 
 
519 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  27.97 
 
 
311 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  26.38 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.82 
 
 
532 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  25.24 
 
 
519 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  25.96 
 
 
544 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  26.21 
 
 
524 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
312 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  30.58 
 
 
545 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  31.9 
 
 
548 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
507 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.28 
 
 
510 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  31.31 
 
 
310 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  34.08 
 
 
305 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  26.84 
 
 
514 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  26.96 
 
 
527 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  30.5 
 
 
312 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 
317 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  26.18 
 
 
519 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 
524 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  26.2 
 
 
521 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
304 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.77 
 
 
305 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  30.62 
 
 
501 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  27.92 
 
 
519 aa  99  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  30.56 
 
 
497 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  25.24 
 
 
311 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 
505 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.32 
 
 
524 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  29.51 
 
 
505 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.27 
 
 
512 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  26.27 
 
 
512 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  25 
 
 
524 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.27 
 
 
512 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.27 
 
 
512 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  35 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  26.2 
 
 
512 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>