More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0657 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 804 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.03 
 
 		 804 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  45.14 
 
 		 804 aa  678    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 		 805 aa  686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  57.14 
 
 		 795 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  45.35 
 
 		 806 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  49.11 
 
 		 795 aa  729    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 804 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  45.35 
 
 		 806 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  48.65 
 
 		 804 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  45.49 
 
 		 815 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  44.6 
 
 		 884 aa  655    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  0.0000000317646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 805 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  48.01 
 
 		 814 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0657  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 861 aa  1766    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 804 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  48.71 
 
 		 805 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  45.47 
 
 		 805 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.65 
 
 		 794 aa  759    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  46.06 
 
 		 806 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  45.69 
 
 		 814 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  47.17 
 
 		 813 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.2 
 
 		 805 aa  698    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.32 
 
 		 805 aa  699    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  45.58 
 
 		 805 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0004  DNA gyrase subunit B  44.42 
 
 		 871 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0729554  hitchhiker  0.0000403413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 806 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0003  DNA gyrase subunit B  46.42 
 
 		 824 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 805 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.07 
 
 		 633 aa  643    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 804 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 805 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 		 640 aa  641    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 		 805 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 804 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 		 795 aa  765    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 		 805 aa  707    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  46.17 
 
 		 769 aa  680    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4146  DNA gyrase subunit B  47.98 
 
 		 868 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  45.71 
 
 		 815 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  48.07 
 
 		 805 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  0.00000387143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  56.49 
 
 		 795 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  46.49 
 
 		 814 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  49 
 
 		 795 aa  728    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  45.35 
 
 		 806 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  48.33 
 
 		 825 aa  735    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  45.12 
 
 		 806 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  46.47 
 
 		 802 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.5 
 
 		 634 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 805 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  49.23 
 
 		 795 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 804 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  57.05 
 
 		 796 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0003  DNA gyrase, B subunit  46.3 
 
 		 859 aa  685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  47.51 
 
 		 870 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  48.13 
 
 		 808 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 804 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  45.8 
 
 		 804 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 804 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  47.72 
 
 		 805 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.19 
 
 		 632 aa  669    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  46.93 
 
 		 805 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  43.92 
 
 		 871 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1285  DNA gyrase, B subunit  52.87 
 
 		 852 aa  854    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  42.76 
 
 		 802 aa  642    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 804 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  44.54 
 
 		 805 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  48.71 
 
 		 805 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  45.93 
 
 		 807 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 805 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.405147  hitchhiker  0.00000000301601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.08 
 
 		 806 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0005  DNA gyrase subunit B  45.52 
 
 		 814 aa  637    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 804 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  49.01 
 
 		 802 aa  744    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 804 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  48.65 
 
 		 807 aa  702    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  49.06 
 
 		 805 aa  699    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  49.18 
 
 		 805 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  47.84 
 
 		 805 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  47.9 
 
 		 805 aa  700    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.64 
 
 		 633 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  46.8 
 
 		 804 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.62 
 
 		 813 aa  693    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 		 806 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  48.71 
 
 		 805 aa  699    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  47.9 
 
 		 805 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5333  DNA gyrase, B subunit  45.66 
 
 		 808 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248882  normal  0.0644472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  60.04 
 
 		 628 aa  687    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  46.08 
 
 		 808 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0004  DNA gyrase, B subunit  45.13 
 
 		 818 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.853499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  48.58 
 
 		 805 aa  698    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  45.43 
 
 		 811 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  57.92 
 
 		 802 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  45.7 
 
 		 806 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  45.74 
 
 		 812 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.51 
 
 		 805 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  46.76 
 
 		 809 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  46.75 
 
 		 804 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0004  DNA gyrase subunit B  46.44 
 
 		 819 aa  651    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0307059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.97 
 
 		 633 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>