More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0684 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0684  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246395  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  82.88 
 
 
280 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  77.55 
 
 
288 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  68.67 
 
 
263 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  68.67 
 
 
263 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  64.9 
 
 
277 aa  189  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  68.21 
 
 
263 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  66.89 
 
 
278 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  64.86 
 
 
262 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  64 
 
 
266 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  63.33 
 
 
266 aa  176  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  63.33 
 
 
275 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  64.9 
 
 
270 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  63.33 
 
 
268 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  64.9 
 
 
270 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  68.87 
 
 
275 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  64.24 
 
 
283 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  64.9 
 
 
270 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  62.67 
 
 
270 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  64.67 
 
 
270 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  62.67 
 
 
270 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  58.67 
 
 
278 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  60.67 
 
 
266 aa  168  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  60.67 
 
 
266 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  62 
 
 
274 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  62 
 
 
274 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  62 
 
 
255 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  62 
 
 
279 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  62.91 
 
 
257 aa  166  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  57.33 
 
 
255 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  62 
 
 
279 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  60.84 
 
 
253 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  62.5 
 
 
312 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  62.67 
 
 
284 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.33 
 
 
256 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  60.67 
 
 
267 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  60 
 
 
276 aa  163  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  63.51 
 
 
261 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  59.33 
 
 
269 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  60 
 
 
271 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  60 
 
 
271 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  59.73 
 
 
291 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  59.33 
 
 
271 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
335 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
335 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
335 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
335 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
273 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
327 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  60.14 
 
 
319 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 
335 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  61.18 
 
 
333 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  58.82 
 
 
326 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  60.14 
 
 
319 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  58.67 
 
 
299 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  60.54 
 
 
260 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.33 
 
 
255 aa  157  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.33 
 
 
255 aa  157  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  59.46 
 
 
319 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  59.46 
 
 
319 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  59.46 
 
 
330 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  60.81 
 
 
335 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  56.67 
 
 
290 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.78 
 
 
319 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  58.11 
 
 
318 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  57.89 
 
 
272 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  59.06 
 
 
249 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  55.7 
 
 
259 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  56.76 
 
 
246 aa  150  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  56.21 
 
 
259 aa  147  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.02 
 
 
240 aa  147  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  57.62 
 
 
270 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  55.03 
 
 
259 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  57.05 
 
 
260 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  57.72 
 
 
258 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  57.43 
 
 
275 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  58.22 
 
 
249 aa  144  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  58 
 
 
267 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
244 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  56.16 
 
 
261 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  52 
 
 
251 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  56.64 
 
 
261 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1668  ABC transporter related  62.16 
 
 
320 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0241971  normal  0.174834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  52.35 
 
 
245 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.99 
 
 
276 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 
245 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
247 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  56.64 
 
 
261 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  53.02 
 
 
245 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  53.64 
 
 
286 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
255 aa  135  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  53.69 
 
 
252 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  53.69 
 
 
265 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  56.38 
 
 
259 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  51.7 
 
 
250 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>