55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5329 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  100 
 
 
301 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  46.01 
 
 
364 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  42.11 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  41.95 
 
 
346 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  41.04 
 
 
359 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  38.71 
 
 
352 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  38.98 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  38.33 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  39.78 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  39.91 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  35.02 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  38.49 
 
 
366 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  39.15 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  40.08 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  33.74 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  34.21 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  33 
 
 
402 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  41.26 
 
 
569 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  39.18 
 
 
353 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  38.37 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  38.37 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  30.27 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  33.19 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  31.08 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  37.68 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  27.75 
 
 
362 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.2 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.26 
 
 
537 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0319  hypothetical protein  46 
 
 
490 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25463  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
403 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.37 
 
 
389 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  39.77 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.55 
 
 
395 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.74 
 
 
219 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  33.08 
 
 
345 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.69 
 
 
431 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.39 
 
 
397 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  34.88 
 
 
391 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  35 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  35 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1765  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.11 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.608782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  32 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.14 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.54 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  31.2 
 
 
235 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  27.81 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  40 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.96 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  27.41 
 
 
422 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1911  cell division ATPase MinD  22.92 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  53.85 
 
 
211 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  30.71 
 
 
388 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  30.18 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  30.23 
 
 
391 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>