28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0319 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0319  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25463  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  38.95 
 
 
402 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  46.45 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  41.14 
 
 
403 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  46.2 
 
 
346 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  39.63 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  44.3 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  44.81 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  45 
 
 
366 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  41.29 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  32.35 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  42.74 
 
 
359 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  48.1 
 
 
364 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  32.69 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  41.09 
 
 
301 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  35.66 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  36.88 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  37.38 
 
 
362 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  40.59 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.79 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  35.25 
 
 
352 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  37.14 
 
 
325 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.41 
 
 
278 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  46.15 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  35.71 
 
 
353 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  34.69 
 
 
353 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  34.69 
 
 
353 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>