34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1383 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  76.99 
 
 
365 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  60.06 
 
 
353 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  60.06 
 
 
353 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  60.06 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  53.8 
 
 
350 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  42.7 
 
 
364 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  45.87 
 
 
355 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  40.17 
 
 
359 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  41.81 
 
 
352 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  44.41 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  41.47 
 
 
359 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  33.82 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  39.67 
 
 
366 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  37.77 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  35.18 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  35.91 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  37.16 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  33.43 
 
 
403 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  41.64 
 
 
357 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  41.75 
 
 
569 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  35.93 
 
 
348 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  31.19 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  37.57 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  35.95 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  35.16 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  39.58 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  32.86 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  29.18 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  39.16 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  37.21 
 
 
235 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.33 
 
 
406 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.37 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>