153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  50.72 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  43.58 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  39.55 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  40.85 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  41.36 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  38.53 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  42.02 
 
 		 353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  41.1 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  41.1 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  35.01 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  36.75 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  38.87 
 
 		 350 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  33.05 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  39.48 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  42.37 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  40.72 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  44.19 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  40.77 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  32.14 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  34.66 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  40.41 
 
 		 569 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  34.71 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  32.27 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  38.41 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  27.95 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  39.15 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  29.97 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  31.88 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  26.64 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  25.78 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1991  septum site-determining protein MinD  27.95 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  27.95 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  26.52 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  23.56 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  42.72 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.18 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  26.79 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.87 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  31.91 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 414 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  26.09 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  27.07 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  26.09 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  22.22 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  24.34 
 
 		 270 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000561907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  24.34 
 
 		 270 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0966  septum site-determining protein MinD  27.51 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  21.83 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  23.89 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  23.89 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  23.89 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.03 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  24.12 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  25.11 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000621875  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.52 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.34 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  30.42 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  24.24 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  23.53 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  23.81 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.18 
 
 		 275 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 		 275 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  23.11 
 
 		 269 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1612  septum site-determining protein MinD  23.79 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00643531  normal  0.221579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  20.09 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  29.36 
 
 		 740 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  20.09 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0320  septum site-determining protein MinD  25.78 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1078  septum site-determining protein MinD  22.03 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000761328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  21.78 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0295  septum site-determining protein MinD  25.59 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0122905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  21.78 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.39 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  21.89 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0286  septum site-determining protein MinD  28.38 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773057  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3688  septum site-determining protein MinD  28.26 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525916  hitchhiker  0.000272147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  29.36 
 
 		 732 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3873  septum site-determining protein MinD  23.79 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.748671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  23.11 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  22.58 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.7 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  21.78 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  21.78 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  21.78 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  35.62 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  23.56 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  21.33 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  21.78 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  35.62 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>