90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0517 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  42.24 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  41.48 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  41.44 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  39.75 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  39.75 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  40.95 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  42.12 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  36.59 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  36.73 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  38.01 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  34.57 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  39.31 
 
 		 359 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  43.84 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  38.92 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  38.64 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  40.38 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  36.62 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  37.34 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  38.71 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  34.36 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  37.1 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  31.48 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  37.44 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  30.86 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  25.82 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  28.5 
 
 		 528 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  23.73 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  31.5 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  26.51 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  33.7 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  36.59 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  27.13 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  23.97 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 587 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  27 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  29.38 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.55 
 
 		 358 aa  46.2  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  23.46 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.05 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  28.9 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.17 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  27.07 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  26.54 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  24.05 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.55 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.29 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  28.11 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  26.29 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02926  hypothetical protein  27.59 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.88 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.41 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  28.05 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.84 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  23.77 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  21.93 
 
 		 411 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1364  septum site-determining protein MinD  25.97 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0739  hypothetical protein  22.27 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  23.2 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.34 
 
 		 431 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  22.42 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  27.47 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  25.31 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  25.41 
 
 		 280 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  26.02 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  26.83 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  21.68 
 
 		 266 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  27.5 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.9 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  26.02 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  29.45 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  26.82 
 
 		 281 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  28.17 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>