74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0053 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1070    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  45.64 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  42.36 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  47.96 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  42.51 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  47 
 
 		 366 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  41.75 
 
 		 365 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  46.57 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  42.27 
 
 		 348 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  44 
 
 		 402 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  40.45 
 
 		 369 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  37.12 
 
 		 364 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0319  hypothetical protein  46.79 
 
 		 490 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25463  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  43.16 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  42.21 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  44.79 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  44.51 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  44.51 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  42.7 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  38.66 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  37.1 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  35.36 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  51.85 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  31.31 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  41.85 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  41.84 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  42.13 
 
 		 357 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  44.3 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  42.53 
 
 		 265 aa  50.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  47.46 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  44.64 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.33 
 
 		 275 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.33 
 
 		 275 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 391 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.77 
 
 		 252 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  35.79 
 
 		 365 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.33 
 
 		 276 aa  47.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 300 aa  47.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07525  nucleotide binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09810)  49.06 
 
 		 331 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.463986 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  32.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  30.71 
 
 		 368 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  43.42 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  39.33 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  37.7 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1273  MRP family ATP-binding protein  44.64 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0109668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  27.41 
 
 		 281 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  50.94 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  40 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  49.06 
 
 		 374 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  36.76 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  44 
 
 		 280 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.17 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  41.67 
 
 		 302 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.7 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  35.9 
 
 		 284 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 289 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  37.7 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  37.93 
 
 		 273 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  44.9 
 
 		 309 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.17 
 
 		 278 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 301 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0114  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.06 
 
 		 262 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20630  hypothetical protein  46.15 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.548267 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  36.47 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.66 
 
 		 370 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  48.15 
 
 		 382 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  37.68 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 360 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 302 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 403 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1023  hypothetical protein  36.07 
 
 		 352 aa  43.5  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>