76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3162 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  32.97 
 
 
369 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  34.42 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  39.45 
 
 
366 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  35.28 
 
 
365 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  38.26 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  36.15 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  32.09 
 
 
403 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  34 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  39.14 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  32.95 
 
 
348 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  34.02 
 
 
364 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  31.3 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  33.46 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  33.46 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  35.69 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  37.46 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  33.83 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  36.36 
 
 
569 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  34.26 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  30.41 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  33.46 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  32.33 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  32.38 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  35.85 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  38.89 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  34.27 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  35.1 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  32.78 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  30.41 
 
 
537 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  34.44 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  32.81 
 
 
756 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.94 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
397 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  28.79 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.51 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 
278 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0773  chromosome partitioning ATPase protein-like  36 
 
 
445 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  29.55 
 
 
782 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.23 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  27.23 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13170  chromosome partitioning ATPase  30.33 
 
 
541 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.768341  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.13 
 
 
414 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  28.51 
 
 
400 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.85 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  22.57 
 
 
269 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  23.35 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.32 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  27.33 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.69 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.82 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  31.08 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  35.4 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
214 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.53 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.55 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0001  hypothetical protein  50 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.50986  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  45.28 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  22.57 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000172441  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  40 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  22.18 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.12 
 
 
751 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  28.66 
 
 
711 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 
294 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  47.62 
 
 
253 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.77 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.93 
 
 
279 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  45.1 
 
 
283 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.21 
 
 
311 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.91 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  25 
 
 
416 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.49 
 
 
253 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.88 
 
 
400 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.27 
 
 
252 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>