31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4296 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  100 
 
 		 402 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  35.66 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0319  hypothetical protein  39.39 
 
 		 490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25463  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  38.64 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  40.12 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  34.63 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  38.64 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  34.5 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  38.42 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  29.82 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  33.72 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  29.75 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  32.69 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  29.68 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  29.97 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  31.91 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  29.24 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  29.61 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  37.93 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  27.57 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  37.84 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  33.33 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  44.16 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  22.88 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  32.27 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  33.67 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2201  chromosome partitioning ATPase  37.7 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1405  chromosome partitioning ATPase  37.7 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  41.84 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  41.84 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>