124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4040 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  90.16 
 
 		 366 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  46.7 
 
 		 346 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  40.62 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  45.69 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  40.17 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  46.79 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  38.91 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  39.42 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  40.85 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  38.42 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  40.35 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  36.78 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  41.21 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  41.78 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  46.31 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  38.83 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  37.06 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  40.75 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  40.75 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  43.2 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  40.91 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  38.11 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  43.06 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  34.96 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  38.49 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  40.64 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  36.91 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  35.16 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  40.08 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0319  hypothetical protein  41.91 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25463  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  27.81 
 
 		 265 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.44 
 
 		 265 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.41 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  28.87 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  23.33 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  30.32 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  28.03 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  36.31 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.75 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 		 264 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0440  septum site-determining protein MinD  23.22 
 
 		 262 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  27.56 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  23.41 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  22.06 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1524  cell division ATPase MinD  22.06 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.016628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  28.57 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  24.85 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  23.08 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  23.08 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  25.3 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  25.47 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  32.68 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.87 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.96 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.91 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  27.01 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  32.2 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  25.45 
 
 		 256 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 256 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.96 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 		 273 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.09 
 
 		 265 aa  46.2  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  24.27 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  30.1 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03531  putative septum site-determining protein MinD  26.29 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03471  putative septum site-determining protein MinD  26.72 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.39 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  24.19 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  26.71 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.92 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  24.51 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  23.23 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  23.6 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  24.38 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  19.28 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  24.44 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.85 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  20.48 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  20.51 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0331  hypothetical protein  29.94 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.3 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  21.15 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>