54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3909 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  49 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  44.57 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  49.68 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  41.02 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  47.4 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  47.4 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  46.67 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  40.85 
 
 		 359 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  45.8 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  37.75 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  41.7 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  42.65 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  40.91 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  43.4 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  36.57 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  37.77 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  38.46 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  37.01 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  45.53 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  36.1 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  39.9 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  36.76 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  38.6 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  42.64 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  32.35 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  36.18 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  39.17 
 
 		 235 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.25 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  20.93 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  40.87 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  37.5 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  23.29 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  23.84 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  43.33 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0331  hypothetical protein  26.46 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  25.91 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1375  hypothetical protein  36 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.144411  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  27.34 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  27.34 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.91 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  27.34 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  42.86 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  25.78 
 
 		 269 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  25.78 
 
 		 269 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0773  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.89 
 
 		 445 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  29.48 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>