277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2359 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  100 
 
 
301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  48.16 
 
 
308 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 
312 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  46.77 
 
 
312 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  42.58 
 
 
326 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  50.35 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.44 
 
 
310 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.58 
 
 
310 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  41.31 
 
 
325 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  33.98 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  31.19 
 
 
310 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  31.19 
 
 
310 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.33 
 
 
315 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  44.1 
 
 
313 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.29 
 
 
310 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 
308 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.71 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.97 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  36 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.97 
 
 
325 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 
302 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.61 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  43.21 
 
 
331 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 
332 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.65 
 
 
311 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  28.94 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  41.67 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 
311 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  28.66 
 
 
306 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  39.14 
 
 
350 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.24 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.24 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.24 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  28.34 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  34.57 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.62 
 
 
320 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  38.67 
 
 
312 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  40.53 
 
 
334 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.44 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  43.31 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  42.35 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  38.94 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  39.14 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  36.01 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.79 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  40.15 
 
 
336 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  26.86 
 
 
308 aa  125  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  30.95 
 
 
303 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  37.37 
 
 
311 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 
315 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  33.97 
 
 
322 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.97 
 
 
312 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  40.59 
 
 
308 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  26.14 
 
 
305 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.32 
 
 
307 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 
319 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 
313 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
324 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
324 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
324 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  32.53 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  37.02 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 
442 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  40.54 
 
 
442 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  30.53 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  30.18 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  35.07 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01950  1-phosphofructokinase  44.22 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.960297  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  40.61 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  36.72 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.32 
 
 
307 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  41.64 
 
 
319 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  36.59 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  28.07 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  28.95 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  29.96 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  37.41 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
319 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.27 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.39 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>