270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1164 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  100 
 
 
353 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 
312 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.07 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.07 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 
308 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.47 
 
 
310 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.41 
 
 
310 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  30.5 
 
 
310 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  30.5 
 
 
310 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.55 
 
 
310 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.36 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.57 
 
 
310 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.77 
 
 
310 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.13 
 
 
315 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.36 
 
 
310 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  28.32 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  28.32 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  28.32 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28.02 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 
303 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 
326 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  27.43 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  28.32 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 
308 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  29.56 
 
 
286 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  26.84 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.67 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  26.84 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  39.03 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  34.42 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.13 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 
315 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  32.94 
 
 
315 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.06 
 
 
313 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  32.94 
 
 
314 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  30.43 
 
 
324 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  35.31 
 
 
322 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 
332 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
315 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  32.6 
 
 
312 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.99 
 
 
318 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  35.4 
 
 
314 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.23 
 
 
315 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  27.94 
 
 
306 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  29.29 
 
 
303 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  24.92 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  25.51 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  25.51 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.3 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  30.12 
 
 
314 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  28.99 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  37.64 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  33.63 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  33.13 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  31.79 
 
 
312 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  39.53 
 
 
301 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
308 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  31.48 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  25.53 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  30.97 
 
 
311 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
314 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  30.68 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  36.42 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  27.63 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  36.7 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.48 
 
 
311 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  31.49 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  31.25 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  38.5 
 
 
319 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  28.28 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  31.54 
 
 
312 aa  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
312 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  29.47 
 
 
330 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 
317 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
313 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
328 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 
325 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 
313 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  30.54 
 
 
312 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  32.5 
 
 
318 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  24.76 
 
 
306 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  31.99 
 
 
312 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  30.61 
 
 
312 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>