288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 312 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  41.83 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.83 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.31 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  47.18 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.97 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  39.39 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.69 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  40.67 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.19 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  29.87 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.17 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.38 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  39.86 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  35.07 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.58 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01950  1-phosphofructokinase  42.62 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.960297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.57 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  26.1 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.24 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.85 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  29.85 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  35.02 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.16 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  34.35 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  38.15 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  30 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  26.6 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  27.55 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.09 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  27.54 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.27 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  37.67 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  32.33 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  36.43 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  35.06 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  35.19 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.29 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  36.79 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  37.13 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.17 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  37.67 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  36.95 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.04 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.68 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  36.08 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.15 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  29.93 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  38.02 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  29.65 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>