274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01950  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 322 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.960297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  41.11 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  42.62 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  40.6 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.4 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  41.76 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.15 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  46.52 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  40.25 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  39.64 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.53 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  38.36 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  38.74 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  27.62 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  34.86 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  36.86 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.76 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  29.76 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  39.31 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.84 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  25.16 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.06 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  38.93 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  34.44 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.21 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  29.94 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  34.94 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  31.97 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  31.99 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  36.68 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.57 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  33.83 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  39.53 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.13 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  35.59 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.63 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  27.8 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  36.7 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.74 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.02 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  33.96 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.39 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.98 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  33.96 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 442 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  33.96 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  36.26 
 
 		 442 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 449 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  27.21 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  32.35 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  32.03 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  36.4 
 
 		 473 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  35.35 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.45 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  30.96 
 
 		 286 aa  90.1  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  29.6 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  29.07 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  28.68 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  26.54 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.97 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>