More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1073 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1073  ABC-3 protein  100 
 
 		 263 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.42889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  57.41 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6286  ABC-3 protein  57.25 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1166  ABC-3 protein  58.52 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  51.92 
 
 		 664 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4811  ABC-3 protein  50 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5110  ABC-3 protein  49.78 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172233  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07780  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  43.91 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4725  hypothetical protein  48.68 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  38.25 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  34.07 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  34.44 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  34.44 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  40.93 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  42.7 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  40.66 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  35.19 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  35.68 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.51 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  35.68 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  33.08 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  33.08 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  37.79 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.58 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 304 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  41.3 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  36.03 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.02 
 
 		 289 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  40.96 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  36.74 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  34.29 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  34.51 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  38.08 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  34.44 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  39.45 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  39.3 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  36.56 
 
 		 289 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.6 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  37.39 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  35.89 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  38.24 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  32.7 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  34.35 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.06 
 
 		 280 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.02 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  34.83 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  32.5 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  36.96 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.33 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  32.05 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  35.79 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  31.73 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  37.35 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 314 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.04 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  37.16 
 
 		 441 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  33.2 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  36.78 
 
 		 441 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.7 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.7 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.7 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.7 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  37 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  35.34 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  35.74 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  38 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.7 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  33.2 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  32.93 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  33.08 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.95 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  35.79 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  36.82 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  33.05 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.58 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  36.84 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  31.92 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>