More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5325 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  100 
 
 
664 aa  1295    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  60.05 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4811  ABC-3 protein  72.73 
 
 
392 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4725  hypothetical protein  72.67 
 
 
373 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5110  ABC-3 protein  78.41 
 
 
240 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172233  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  59.22 
 
 
257 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  58.5 
 
 
254 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  57.58 
 
 
303 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6286  ABC-3 protein  58.33 
 
 
292 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1166  ABC-3 protein  63.67 
 
 
294 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07780  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  45.38 
 
 
298 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  36.13 
 
 
379 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  38.24 
 
 
399 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1073  ABC-3 protein  53.51 
 
 
263 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.42889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  36.7 
 
 
285 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  35.05 
 
 
405 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.86 
 
 
304 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  34.68 
 
 
287 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.5 
 
 
287 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  40.37 
 
 
269 aa  145  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.39 
 
 
289 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  36.56 
 
 
312 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.87 
 
 
288 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
288 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.85 
 
 
285 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.98 
 
 
288 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.98 
 
 
288 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  37.87 
 
 
280 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  38.6 
 
 
281 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.18 
 
 
297 aa  134  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.18 
 
 
297 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.18 
 
 
297 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  32.81 
 
 
285 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.34 
 
 
303 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
277 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.74 
 
 
286 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.37 
 
 
312 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.15 
 
 
279 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.47 
 
 
288 aa  126  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.22 
 
 
282 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  32.43 
 
 
445 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.23 
 
 
282 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.23 
 
 
282 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.23 
 
 
282 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.23 
 
 
282 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  35.48 
 
 
312 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.23 
 
 
282 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.16 
 
 
289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.24 
 
 
278 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.24 
 
 
278 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  30.88 
 
 
278 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  29.7 
 
 
291 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.47 
 
 
306 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.09 
 
 
285 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.34 
 
 
285 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.85 
 
 
281 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.85 
 
 
291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.59 
 
 
280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.88 
 
 
277 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  29.23 
 
 
285 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  32.35 
 
 
314 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.34 
 
 
286 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.34 
 
 
286 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.34 
 
 
286 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.34 
 
 
286 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.8 
 
 
287 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.85 
 
 
285 aa  117  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.34 
 
 
286 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  31.72 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.81 
 
 
280 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.85 
 
 
285 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.75 
 
 
281 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.46 
 
 
285 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  26.97 
 
 
294 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  31.1 
 
 
441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.68 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  32.86 
 
 
286 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.95 
 
 
278 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  33.2 
 
 
304 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.39 
 
 
280 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  32.74 
 
 
274 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  32.06 
 
 
279 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  27.96 
 
 
290 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.75 
 
 
276 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  31.5 
 
 
285 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  27.78 
 
 
268 aa  110  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
278 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  26.54 
 
 
286 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.47 
 
 
283 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.26 
 
 
272 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  28.32 
 
 
290 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  32.34 
 
 
289 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.62 
 
 
276 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  27.34 
 
 
286 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.08 
 
 
275 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 
264 aa  108  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
275 aa  107  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  25.3 
 
 
296 aa  107  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  30.42 
 
 
279 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.16 
 
 
277 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>