More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6286 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6286  ABC-3 protein  100 
 
 		 292 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  59.8 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1166  ABC-3 protein  71.84 
 
 		 294 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  58.33 
 
 		 664 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4811  ABC-3 protein  59.77 
 
 		 392 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4725  hypothetical protein  60.25 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5110  ABC-3 protein  60.43 
 
 		 240 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172233  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07780  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.36 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1073  ABC-3 protein  58.77 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.42889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  37 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  38.7 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  44 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.56 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  42.64 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  39.27 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  34.19 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  43.28 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  34.36 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  34.36 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.8 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  37.73 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  39.13 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  37.4 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  36 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  33.45 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  33.45 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  38.87 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  34.03 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  36.43 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.9 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.29 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  34.52 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  34.75 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  34.84 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  36.8 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  39.47 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  35.88 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  34.52 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  35.48 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  35.76 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  34.89 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.78 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.74 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  35.97 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  33.2 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.98 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  34.07 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  33.73 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  34.57 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.19 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  35.15 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  34.18 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  35.92 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.61 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.71 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.71 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.71 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.71 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.71 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  36.51 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.12 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  32.14 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.7 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.14 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  26.55 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  29.43 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  36.23 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  37.22 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  32.02 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  38.32 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.83 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.52 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>